트르륵 하는 소리가 뭔지는 잘 모르겠지만, 얼핏 두가지 경우가 아닐까 생각합니다.
첫째는 클러치 페달을 완전히, 끝까지 밟아주지 않고 변속했을 경우,
둘째는 충분한 가속이 되지 않은 상태에서 변속을 한 경우입니다.
제 생각에는 아마 두번째 충분한 가속이 되지않은 상태에서 변속하신 것 같습니다.
RPM을 3000-4000정도까지 올린 다음에 변속을 해보세요.

제생각에는 클러치페달을 끝까지 안밟아서 그런거 같네요.

근데 그렇게 하면 기어 다 나가는데요.

제가 시빅 si를 잠시 운전해본 적이 있는데, 그 차는 클러치 유격이 좀 짧더군요. 이게 차종마다 다르고, 같은 차라도 다를 수 있다고 듣긴 했는데,
그 짧은 유격 때문에 클러치를 조금만 떼도 차가 움직입니다.

클러치가 좀 민감해서, 시동 꺼트리기도 쉽더군요.

이게 전 시빅 Si에 적용이 된다면 클러치를 끝까지 밟지 않으면 클러치 판이 살짝 닿아있어서 나는 소리일 수도 있습니다.

그런데 2-3단에서만 나는 것은 좀 이상하네요.